40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0640 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0640  NnrS protein  100 
 
 
445 aa  875    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  36.52 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  26.96 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  24.07 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  24.88 
 
 
444 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  29.61 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  29.61 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  25.24 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  27.51 
 
 
398 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  25.25 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  24.77 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  24.02 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  24.77 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  24.77 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  24.77 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  24.77 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  24.77 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  24.77 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  26.29 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  23.22 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  25.81 
 
 
398 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  23.43 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  32.58 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  27.85 
 
 
403 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  25.2 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  24.05 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  26.32 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  23.42 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  23.85 
 
 
394 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  24.12 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  27.27 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  23.95 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  23.58 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  22.29 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  23.04 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  25.54 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  24.06 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  24.26 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  27.43 
 
 
401 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  30 
 
 
393 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>