77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3397 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  100 
 
 		 418 aa  792    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  29.1 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  36.19 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  33.78 
 
 		 444 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  34.01 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  28.75 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1485  NnrS family protein  29.77 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0573002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0640  NnrS protein  31.38 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  27.41 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  30.46 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  29.27 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  29.26 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  32.97 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  27.36 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  27.36 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  27.36 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  27.36 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  27.36 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  25.3 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  25.62 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  27.36 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  31.25 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  31.25 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  37.63 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  29.44 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  29.57 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  37.63 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  30.55 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  27.11 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  26.93 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  28.7 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  27.68 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  33.83 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  27.68 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  27.8 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  26.98 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.29 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  35.43 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  35.19 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  30.53 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  29.95 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  27.82 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  30.75 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  34.02 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  38.38 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  32.24 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  25.92 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  32.87 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  37.25 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  33.18 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  29.4 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  28.46 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  31.73 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  27.87 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  37.25 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  31.51 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  31.25 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  33.66 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  24.24 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  33.71 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  30.61 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  32.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  32.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  28.95 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  28.51 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  34.34 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  34.74 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  26.43 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  35.42 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  29.71 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  29.71 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  26.41 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  30.77 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>