73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2515 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2515  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
425 aa  882    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0697  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1701  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
431 aa  183  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1717  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
433 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1588  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
427 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1539  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
427 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0388449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
393 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  20.91 
 
 
889 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.08 
 
 
769 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 
409 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
389 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  25.2 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  20.43 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
389 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  28.23 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
376 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
370 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  24 
 
 
440 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
391 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
380 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  21.21 
 
 
412 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
392 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1143  hypothetical protein  27.19 
 
 
505 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.517654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.55 
 
 
770 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  22.97 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  27.45 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
1991 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0980  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.09 
 
 
365 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
358 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
422 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2336  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000420527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.53 
 
 
393 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
398 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  28.07 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>