31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_259 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1722    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  27.89 
 
 		 865 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  27.43 
 
 		 856 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  28.39 
 
 		 953 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  26.14 
 
 		 971 aa  111  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  26.09 
 
 		 832 aa  105  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.23 
 
 		 856 aa  103  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  22.76 
 
 		 835 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  24.59 
 
 		 832 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  25.61 
 
 		 872 aa  90.9  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  26.81 
 
 		 1016 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  26.52 
 
 		 1016 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  22.99 
 
 		 838 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  20.68 
 
 		 835 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  24.23 
 
 		 865 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  22.71 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  22.27 
 
 		 873 aa  78.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  21.27 
 
 		 850 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  22 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  24.08 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  28.47 
 
 		 730 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  26.32 
 
 		 679 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  26.11 
 
 		 732 aa  60.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1135  PglZ domain protein  23.83 
 
 		 786 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  20.54 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  24.28 
 
 		 868 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  25 
 
 		 679 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1324  PglZ domain protein  22.52 
 
 		 777 aa  52  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0766766  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  20.98 
 
 		 868 aa  51.6  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  22.75 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  24.63 
 
 		 784 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>