30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1157 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  100 
 
 
953 aa  1888    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  38.73 
 
 
971 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  39.52 
 
 
1016 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  39.62 
 
 
1016 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  27 
 
 
856 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  27.01 
 
 
865 aa  140  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  26.23 
 
 
841 aa  129  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  27.41 
 
 
838 aa  98.2  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  29.13 
 
 
850 aa  97.8  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1158  hypothetical protein  57.5 
 
 
250 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  22.12 
 
 
832 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  26.71 
 
 
835 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  23.09 
 
 
835 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  25 
 
 
865 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  24.05 
 
 
832 aa  81.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  23.38 
 
 
873 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  22.95 
 
 
873 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  26.97 
 
 
872 aa  75.1  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.43 
 
 
866 aa  72  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  26.24 
 
 
868 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  25.85 
 
 
868 aa  65.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  24.81 
 
 
856 aa  65.1  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  25.54 
 
 
746 aa  57.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  24.02 
 
 
784 aa  55.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3232  hypothetical protein  26.33 
 
 
785 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  24.92 
 
 
732 aa  51.6  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  23.5 
 
 
740 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  22.89 
 
 
775 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  24.29 
 
 
730 aa  45.8  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  23.57 
 
 
769 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>