25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  100 
 
 		 856 aa  1750    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  29.66 
 
 		 832 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  29.01 
 
 		 835 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  30.38 
 
 		 832 aa  351  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  28.81 
 
 		 835 aa  343  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  29.87 
 
 		 838 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  26.74 
 
 		 865 aa  251  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  23.33 
 
 		 873 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  27.26 
 
 		 872 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  23.63 
 
 		 873 aa  200  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  25.03 
 
 		 866 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  25.03 
 
 		 868 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  24.06 
 
 		 850 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  30.73 
 
 		 868 aa  148  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  25.23 
 
 		 865 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  25.65 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  26.32 
 
 		 856 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  24.82 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  24.54 
 
 		 1016 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  24.68 
 
 		 1016 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  24.81 
 
 		 953 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  26.33 
 
 		 732 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  25.09 
 
 		 769 aa  51.2  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  25.18 
 
 		 740 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  23.83 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>