25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2489 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  100 
 
 
873 aa  1814    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  32.15 
 
 
873 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  30.61 
 
 
866 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  30.69 
 
 
868 aa  361  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  29.91 
 
 
872 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  28.05 
 
 
865 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  28.93 
 
 
850 aa  335  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  27.4 
 
 
832 aa  319  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  27.18 
 
 
832 aa  312  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  25.34 
 
 
835 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  25.76 
 
 
838 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  27.26 
 
 
835 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  31.82 
 
 
868 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  27.49 
 
 
856 aa  162  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  24.8 
 
 
865 aa  98.2  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  24.65 
 
 
856 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  23.38 
 
 
953 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  23.12 
 
 
841 aa  73.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  21.92 
 
 
971 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0745  hypothetical protein  40.4 
 
 
102 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.437281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  22.68 
 
 
1016 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  22.68 
 
 
1016 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  24.56 
 
 
746 aa  53.5  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1040  two-component response regulator  24.19 
 
 
518 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.429651  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  23.27 
 
 
732 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>