24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3079 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  100 
 
 
971 aa  1983    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  46.55 
 
 
1016 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  45.92 
 
 
1016 aa  770    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  38.43 
 
 
953 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  29.05 
 
 
856 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  29.4 
 
 
865 aa  137  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  26.14 
 
 
841 aa  111  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.88 
 
 
838 aa  91.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  27.27 
 
 
850 aa  88.6  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  24.88 
 
 
832 aa  88.2  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  27.27 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  24.16 
 
 
835 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  24.81 
 
 
835 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  21.96 
 
 
832 aa  76.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1158  hypothetical protein  43.24 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  23.83 
 
 
873 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  24.82 
 
 
856 aa  68.2  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  21.49 
 
 
873 aa  66.6  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  22.58 
 
 
740 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.24 
 
 
866 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  22.38 
 
 
784 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  25.43 
 
 
868 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  24.05 
 
 
746 aa  49.3  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  23.79 
 
 
872 aa  48.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>