28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1607 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1707    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  54.61 
 
 
835 aa  972    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  64.2 
 
 
838 aa  1139    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  44.72 
 
 
835 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  65.5 
 
 
832 aa  1170    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  30 
 
 
868 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  30.96 
 
 
865 aa  365  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  29.66 
 
 
856 aa  359  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  29.99 
 
 
872 aa  347  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  29.98 
 
 
866 aa  347  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  29.26 
 
 
850 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  27.31 
 
 
873 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  27.76 
 
 
873 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  28.59 
 
 
868 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  26.61 
 
 
865 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  24.95 
 
 
856 aa  125  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  26.09 
 
 
841 aa  105  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  22.63 
 
 
953 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  27.27 
 
 
732 aa  78.2  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  21.96 
 
 
971 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  22.24 
 
 
1016 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  21.84 
 
 
1016 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  25.73 
 
 
730 aa  61.2  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  23.3 
 
 
769 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  22.57 
 
 
746 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  21.13 
 
 
516 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2906  response regulator receiver protein  22.63 
 
 
517 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1753  hypothetical protein  24.21 
 
 
797 aa  44.3  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>