24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3188 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  100 
 
 
732 aa  1488    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  48.61 
 
 
730 aa  685    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  27.27 
 
 
832 aa  78.2  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  27.67 
 
 
838 aa  75.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  28.47 
 
 
835 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  26.55 
 
 
865 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  27.94 
 
 
832 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  24 
 
 
775 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  26.06 
 
 
835 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  26.3 
 
 
850 aa  61.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  27.14 
 
 
866 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  22.95 
 
 
872 aa  60.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  26.11 
 
 
841 aa  60.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  25.91 
 
 
856 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  24.23 
 
 
868 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  23.8 
 
 
769 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  22.43 
 
 
873 aa  55.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  22.61 
 
 
679 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  24.64 
 
 
746 aa  54.3  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.33 
 
 
856 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  24.92 
 
 
953 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  21.84 
 
 
679 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1135  PglZ domain protein  28.65 
 
 
786 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  23.27 
 
 
873 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>