29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1125 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  100 
 
 		 856 aa  1729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  27.89 
 
 		 865 aa  270  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  27.43 
 
 		 841 aa  230  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  26.63 
 
 		 953 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  29.05 
 
 		 971 aa  158  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  25.27 
 
 		 850 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  27.27 
 
 		 1016 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  29.02 
 
 		 835 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  26.89 
 
 		 1016 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  24.95 
 
 		 832 aa  125  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  26.33 
 
 		 838 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  26.26 
 
 		 835 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  30.1 
 
 		 866 aa  101  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  23.96 
 
 		 832 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  25.68 
 
 		 873 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  25.53 
 
 		 872 aa  94  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.32 
 
 		 856 aa  91.3  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  25.31 
 
 		 865 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  27.67 
 
 		 868 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  22.53 
 
 		 868 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  24.4 
 
 		 873 aa  71.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  22.98 
 
 		 746 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  25.91 
 
 		 732 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1135  PglZ domain protein  26.59 
 
 		 786 aa  55.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  20.24 
 
 		 740 aa  55.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  25.27 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  23.08 
 
 		 784 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  25.31 
 
 		 775 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4279  alkaline phosphatase domain-containing protein  24.32 
 
 		 908 aa  44.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>