25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0602 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  46.46 
 
 
971 aa  808    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  98.43 
 
 
1016 aa  1958    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  100 
 
 
1016 aa  1995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  39.94 
 
 
953 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  25.7 
 
 
856 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  26.99 
 
 
865 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  27.25 
 
 
841 aa  98.2  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  23.74 
 
 
835 aa  82  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.23 
 
 
856 aa  76.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  22.24 
 
 
832 aa  76.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  23.45 
 
 
832 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  25.43 
 
 
835 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  24.19 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  23.43 
 
 
873 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.62 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1158  hypothetical protein  51.61 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  22.92 
 
 
873 aa  63.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  24.93 
 
 
865 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  22.37 
 
 
866 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  25.5 
 
 
868 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  25.25 
 
 
872 aa  53.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  26.46 
 
 
775 aa  52.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3232  hypothetical protein  25.2 
 
 
785 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  24.09 
 
 
784 aa  49.3  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  23.7 
 
 
868 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>