29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2106 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  100 
 
 		 865 aa  1758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  28.01 
 
 		 841 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  27.89 
 
 		 856 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  28.54 
 
 		 838 aa  158  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  26.61 
 
 		 832 aa  145  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  29.4 
 
 		 971 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  27.5 
 
 		 832 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  27.07 
 
 		 953 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  24.01 
 
 		 835 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  26.02 
 
 		 835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.24 
 
 		 856 aa  119  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  25.37 
 
 		 872 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  26.82 
 
 		 866 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  29.92 
 
 		 1016 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  29.71 
 
 		 1016 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  25.7 
 
 		 865 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  24.8 
 
 		 873 aa  98.2  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  25.41 
 
 		 850 aa  97.8  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  25.97 
 
 		 868 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  25.59 
 
 		 873 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  27.27 
 
 		 868 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  22.1 
 
 		 746 aa  56.6  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  23.82 
 
 		 679 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  23.2 
 
 		 679 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  25.68 
 
 		 769 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  24.35 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  23.46 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  23.05 
 
 		 784 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  24.75 
 
 		 732 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>