15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1711 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1390    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  96.61 
 
 		 679 aa  1318    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  40.23 
 
 		 775 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  38.63 
 
 		 784 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1135  PglZ domain protein  38.86 
 
 		 786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3232  hypothetical protein  36.6 
 
 		 785 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1324  PglZ domain protein  33.76 
 
 		 777 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0766766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  30.04 
 
 		 769 aa  296  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  24.63 
 
 		 841 aa  64.7  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  25.28 
 
 		 730 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  21.84 
 
 		 732 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  24.62 
 
 		 865 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  26.53 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.77 
 
 		 866 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  23.42 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>