23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0998 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1541    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  33.24 
 
 
740 aa  438  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  22.98 
 
 
856 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2753  hypothetical protein  26.44 
 
 
775 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2237  hypothetical protein  25 
 
 
784 aa  64.3  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  22.57 
 
 
832 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  25.54 
 
 
953 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  26.32 
 
 
868 aa  55.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  24.64 
 
 
732 aa  54.3  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  21.88 
 
 
865 aa  54.3  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  22.74 
 
 
873 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  24.56 
 
 
873 aa  53.5  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  20.97 
 
 
850 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  22.75 
 
 
841 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  24.05 
 
 
971 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  23.15 
 
 
838 aa  49.3  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  26.94 
 
 
679 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  24.15 
 
 
868 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  25.77 
 
 
730 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1711  hypothetical protein  26.53 
 
 
679 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  24.6 
 
 
832 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  20.32 
 
 
769 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  23 
 
 
835 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>