15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2040 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2040  PglZ domain protein  100 
 
 
740 aa  1524    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  33.24 
 
 
746 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  22.58 
 
 
971 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  20.54 
 
 
841 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  21.15 
 
 
873 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  20.54 
 
 
856 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1775  alkaline phosphatase domain-containing protein  35.35 
 
 
298 aa  55.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  23.02 
 
 
679 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  21.75 
 
 
872 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  22.44 
 
 
866 aa  51.6  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  22.68 
 
 
868 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  23.5 
 
 
953 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  25.18 
 
 
856 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  23.45 
 
 
850 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3232  hypothetical protein  18.34 
 
 
785 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>