23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0340 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  100 
 
 
865 aa  1805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  36.12 
 
 
866 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  34.73 
 
 
872 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  35.05 
 
 
868 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  31.12 
 
 
835 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  30.96 
 
 
832 aa  365  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  29.93 
 
 
832 aa  351  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  31.13 
 
 
835 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  29.48 
 
 
838 aa  337  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  27.94 
 
 
873 aa  334  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  29.27 
 
 
850 aa  290  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  28.15 
 
 
873 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  26.74 
 
 
856 aa  231  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  32.66 
 
 
868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  25.7 
 
 
865 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  25.31 
 
 
856 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  27.27 
 
 
971 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  24.23 
 
 
841 aa  82.8  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  25 
 
 
953 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  26.55 
 
 
732 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  26.49 
 
 
1016 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  25.21 
 
 
730 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  26.16 
 
 
1016 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>