24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3730 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  46.53 
 
 
835 aa  832    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  50.84 
 
 
832 aa  888    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  44.72 
 
 
832 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  49.35 
 
 
838 aa  857    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  100 
 
 
835 aa  1710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  31.13 
 
 
866 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  31.13 
 
 
865 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  30.72 
 
 
868 aa  334  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  29.01 
 
 
856 aa  330  9e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  28.15 
 
 
873 aa  300  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  29.69 
 
 
850 aa  299  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  29.64 
 
 
872 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  26.94 
 
 
873 aa  282  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  33.55 
 
 
868 aa  207  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  29.02 
 
 
856 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  26.02 
 
 
865 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  22.76 
 
 
841 aa  100  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  26.71 
 
 
953 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  25 
 
 
971 aa  78.2  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3188  PglZ domain protein  28.47 
 
 
732 aa  75.1  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  27.65 
 
 
1016 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  27.7 
 
 
1016 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1078  hypothetical protein  22.37 
 
 
769 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.145128  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  24.91 
 
 
730 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>