More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_133 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0126  anthranilate phosphoribosyltransferase  87.43 
 
 
374 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.315556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_133  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
374 aa  763    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0245  anthranilate phosphoribosyltransferase  89.57 
 
 
374 aa  686    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0672448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3255  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
374 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1582  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
368 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0993  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 
363 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0086  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
359 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
343 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6801  Anthranilate phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
370 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1143  anthranilate phosphoribosyl transferase  35.51 
 
 
363 aa  208  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0745107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
339 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
356 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00198248  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
341 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 
345 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
344 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
341 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
352 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
350 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1114  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3624  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
340 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
352 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
338 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
341 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
341 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
350 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2363  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
353 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0546915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
341 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0064  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
346 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
352 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4170  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
337 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
339 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
344 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4197  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
337 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0332622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
341 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
337 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.43 
 
 
341 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.43 
 
 
341 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.43 
 
 
341 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
349 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
341 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
341 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1138  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4054  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0603  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.84 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.421903  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1395  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00625631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1132  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2768  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1552  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
334 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1771  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.983535  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 
332 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
339 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1281  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
336 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 
338 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2563  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
350 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0973109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
341 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
338 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 
343 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.58 
 
 
338 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0709  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
351 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 
338 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
352 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
340 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
336 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2932  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
341 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336453  normal  0.763588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06921  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
344 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0742709  normal  0.398882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
349 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1741  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
351 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 
340 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
336 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10351  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
342 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
336 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 
346 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1558  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
335 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.145507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1774  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
337 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0631  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
346 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
336 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
337 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0358  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.150136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08350  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0791  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
349 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
347 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>