More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1255 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1255  putative oxidoreductase  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0882151  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  53.37 
 
 
323 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  47.12 
 
 
323 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  46.92 
 
 
323 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  47.39 
 
 
323 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
323 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  41.06 
 
 
329 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  36.7 
 
 
329 aa  128  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  29.81 
 
 
327 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
329 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
339 aa  104  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  35.81 
 
 
331 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  36.68 
 
 
327 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  35.75 
 
 
328 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  33.5 
 
 
327 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
325 aa  98.2  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.21 
 
 
308 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  34.83 
 
 
327 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
328 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
309 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.25 
 
 
308 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  33.67 
 
 
328 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.56 
 
 
330 aa  94.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  32.23 
 
 
328 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  34.55 
 
 
325 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  33.48 
 
 
338 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
328 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  33.8 
 
 
325 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  33.17 
 
 
326 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
330 aa  90.1  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  33.16 
 
 
328 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  33.68 
 
 
328 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
317 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  33.18 
 
 
326 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  34.04 
 
 
318 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
312 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  34.63 
 
 
314 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  29.38 
 
 
332 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  35.79 
 
 
309 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  30.88 
 
 
326 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  32.11 
 
 
328 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  29.19 
 
 
326 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
330 aa  85.1  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  30.73 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  33.17 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  39.52 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  33.15 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  30.33 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  33.82 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  32.52 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  32.82 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  27.67 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  30.52 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  27.37 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.05 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  32.28 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  31.75 
 
 
319 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
327 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.09 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5178  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  30.57 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  31.75 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  32.86 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  31.12 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  27.14 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  30.16 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  31.75 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  31.84 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  29.69 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  26.88 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  30.66 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  32.21 
 
 
325 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.85 
 
 
325 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  29.36 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  30.62 
 
 
344 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  31 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0494  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.722341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  30.14 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  26.96 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  31.1 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  32.46 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0554  aldo/keto reductase  28.5 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  31.12 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  29.1 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  28.5 
 
 
319 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>