46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0892 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  43.98 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  45.38 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  41.64 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  33.2 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  37.83 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  42.41 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  31.25 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  29.18 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  32.51 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  31.63 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  31.4 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  31.4 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  31.63 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  32.23 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  30.13 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  29.66 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  43.59 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  29.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  29.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  26.17 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  27.41 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  25.22 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  25.21 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  22.57 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  23.42 
 
 		 325 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  27.7 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  27.7 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  33.75 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  33.75 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  34.72 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  31.52 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  33.75 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2616  primosome, DnaD subunit  29.17 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00360239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  34.72 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  26.37 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  25.84 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  30.26 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0042  primosome, DnaD subunit  30.77 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  28 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>