18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2419 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  100 
 
 		 325 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0042  primosome, DnaD subunit  51.53 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  25 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  25.54 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  25.54 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0106  primosome, DnaD subunit  26.14 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  29.37 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  22.7 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  23.23 
 
 		 249 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  23.42 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  27.38 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1202  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2045  primosome, DnaD subunit  22.14 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000903409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  27.88 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  34.48 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  31.82 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  26.32 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  22.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>