23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2622 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  100 
 
 		 333 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  100 
 
 		 333 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  36.14 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0106  primosome, DnaD subunit  29.83 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2045  primosome, DnaD subunit  30.03 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000903409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0042  primosome, DnaD subunit  25.86 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0537  primosome, DnaD subunit  28.08 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  25.54 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1202  hypothetical protein  23.13 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  27.7 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  27.47 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  26.96 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  33.82 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>