52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2786 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 258 aa  533  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  32.69 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  31.42 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  31.98 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  31.25 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  32.48 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  30.18 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  29.73 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  29.18 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  29.87 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  32.34 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  29.19 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  26.29 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  24.89 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  24.79 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  25.11 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  24.88 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  24.88 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  36.63 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  33.7 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  22.27 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  31.91 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  33.33 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  32.1 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  40.3 
 
 		 430 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  33.75 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  33.72 
 
 		 354 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  30.11 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  34.52 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  26.96 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  26.96 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  34.52 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  35.8 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  31 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  34.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  34.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  27.88 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  34.57 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  34.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  34.57 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  34.57 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0042  primosome, DnaD subunit  25 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>