45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2110 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  75.74 
 
 		 233 aa  358  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  59.83 
 
 		 235 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  59.83 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  59.4 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  58.97 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  59.83 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  59.83 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  59.83 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  59.83 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  59.83 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  59.4 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  59.4 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  36.65 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  36.65 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  34.84 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  35.12 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  35.53 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  36.36 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  35.87 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  34.16 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  33.67 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  39.34 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  30.88 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  31.62 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  33.06 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  31.34 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  28.8 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  29.23 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  41.43 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  25.69 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  33.68 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  30.56 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  32.26 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  22.44 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  22.81 
 
 		 381 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  29.79 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  25.89 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  30 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  33.33 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  26.32 
 
 		 325 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0040  DnaD and phage-associated region  22.8 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  34.25 
 
 		 333 aa  42  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 333 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>