25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0040 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0040  DnaD and phage-associated region  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  32.26 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  42.65 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  41.18 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  31.76 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0323  primosome, DnaD subunit  30.86 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2075  primosome, DnaD subunit  30.86 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.760964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0332  primosome, DnaD subunit  30.86 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2038  primosome, DnaD subunit  30.86 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  41.18 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  41.18 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  41.18 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  41.18 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  41.18 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  32.39 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  33.8 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  36.76 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  40.82 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  36 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  39.71 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  41.07 
 
 		 430 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2981  hypothetical protein  43.14 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  21.35 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  26.56 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  25 
 
 		 235 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>