33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1204 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  45.89 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  39.62 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  27.78 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  27.75 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  27.75 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  27.88 
 
 		 235 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  28.21 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  28.21 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  28.21 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  28.21 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  28.21 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  28.21 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  28.21 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  36.96 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  26.82 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  26.67 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  29.39 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  28.09 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  26.96 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  26.42 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  25.91 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  28.19 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  26.09 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  40.66 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  24.37 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  32.11 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  37.63 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  29.58 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  29.58 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  32.1 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0040  DnaD and phage-associated region  36 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0537  primosome, DnaD subunit  29.87 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>