57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2103 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  41.88 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  41.64 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  39.78 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  32.17 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  31.42 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  31.82 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  31.05 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  33.64 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  26.85 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  29.07 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  27.7 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  25.33 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  30.97 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  29.44 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  28.26 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  28.26 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  25.21 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  26.67 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  35.71 
 
 		 409 aa  75.5  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  27.27 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  24.3 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  24.3 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  30.15 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  32.5 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  30.85 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  31.25 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  31.17 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  30.38 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  30.93 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  34.38 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  24.43 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  34.07 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  34.07 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  36.49 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  36.49 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  36.49 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  36.49 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  35.14 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  35.14 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  30.26 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.26 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  30.26 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.26 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.26 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  27.45 
 
 		 381 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  33.78 
 
 		 158 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  27.18 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  31.82 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0537  primosome, DnaD subunit  22.69 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  29.79 
 
 		 248 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>