32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1027 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  34.83 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  34.83 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  34.33 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  33.83 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  33.66 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  34.33 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  32.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  33.16 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  33.16 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  34.31 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  30.33 
 
 		 272 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  31.05 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  31.5 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  29.56 
 
 		 251 aa  98.6  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  31.4 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  32.23 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  29.19 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  30.26 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  36.96 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  28.14 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  30.52 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  23.13 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  44.44 
 
 		 409 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  28.97 
 
 		 381 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>