43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0703 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 409 aa  828    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1403  hypothetical protein  45.07 
 
 		 329 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2953  hypothetical protein  44.29 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000832584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  52.1 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  40.18 
 
 		 272 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  43.59 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  35.71 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  41.41 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  40.66 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  40.24 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  41.43 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  39.73 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  31.01 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  39.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  39.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  36.63 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  35.24 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  23.36 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  44.44 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  26 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  32.56 
 
 		 247 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  32.56 
 
 		 290 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  30.99 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  31.96 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  30.99 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  30.99 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  35 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  35 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  32.58 
 
 		 211 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2616  primosome, DnaD subunit  30 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00360239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  29.87 
 
 		 295 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0537  primosome, DnaD subunit  30.99 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  27.96 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  30.11 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  27.21 
 
 		 222 aa  43.9  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>