16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2616 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2616  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
321 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00360239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  50.16 
 
 
354 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  46.81 
 
 
290 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  45.04 
 
 
290 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  45.19 
 
 
247 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1403  hypothetical protein  43.02 
 
 
358 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  38.27 
 
 
295 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  27.03 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  39.71 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  39.71 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  40.3 
 
 
228 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  36.62 
 
 
249 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  30 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  29.79 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  29.17 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  29.79 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>