41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1023 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  78.07 
 
 		 228 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  78.07 
 
 		 228 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  36.07 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  35.16 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  35.62 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  35.16 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  34.25 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  34.25 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  34.25 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  34.84 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  34.25 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  32.14 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  28.72 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  28.57 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  31.49 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  27.81 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  27.7 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  27.92 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  27.32 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  28.29 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  27.96 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  26.17 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  25.11 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  31.91 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  32.11 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  25 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  30.99 
 
 		 409 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2616  primosome, DnaD subunit  40.3 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00360239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  34.15 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  28.18 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  32.93 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  32.93 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  34.48 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  29.07 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  25.25 
 
 		 430 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 286 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>