39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1269 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
235 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  88.94 
 
 
235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  89.36 
 
 
235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  89.79 
 
 
235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  89.79 
 
 
235 aa  427  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  89.79 
 
 
235 aa  427  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  89.79 
 
 
235 aa  427  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  89.79 
 
 
235 aa  427  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  89.79 
 
 
235 aa  427  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  89.36 
 
 
235 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  89.36 
 
 
235 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  58.97 
 
 
235 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  55.56 
 
 
233 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  36.07 
 
 
228 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  35.45 
 
 
228 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  35.45 
 
 
228 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  37.62 
 
 
249 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  33.33 
 
 
214 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  35.02 
 
 
263 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  30.46 
 
 
251 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  31.98 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  29.06 
 
 
242 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  29.33 
 
 
211 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  33.97 
 
 
272 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  26.75 
 
 
234 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  32.51 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  27.78 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  29.07 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  28.02 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  39.73 
 
 
409 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  26.24 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  35.06 
 
 
286 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  24.56 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2622  DNA replication protein DnaD, putative  33.82 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2939  putative DNA replication protein DnaD  33.82 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  26 
 
 
311 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  27.37 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  27.37 
 
 
309 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  27.38 
 
 
316 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>