37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0509 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  75.74 
 
 		 235 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  55.56 
 
 		 235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  54.27 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  53.85 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  53.85 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  52.14 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  52.14 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  52.14 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  52.14 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  52.14 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  51.71 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  51.71 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  36.99 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  36.99 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  33.18 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  38.92 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  36.56 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  41.85 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  34.33 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  34.96 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  32.35 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  29.78 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  33.64 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  28.7 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  31.1 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  32.34 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  25.91 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  25.65 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  40.24 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  21.86 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  28.42 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  27.38 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  21.76 
 
 		 324 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl202  hypothetical protein  29.11 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.406667  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3046  hypothetical protein  23.23 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00711935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  26.14 
 
 		 311 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>