33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0918 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  100 
 
 		 234 aa  483  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  36.22 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  29.77 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  26.75 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  27.04 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  27.04 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  27.04 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  28.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  28.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  28.79 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  31.4 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  27.08 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  27.95 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  26.76 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  25.21 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  22.67 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  25.85 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  25.85 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  27.32 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  24.79 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  25.45 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  25.91 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  25.22 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  26.15 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  26.24 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  36.19 
 
 		 409 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  22.11 
 
 		 324 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  29.49 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  30.3 
 
 		 325 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>