More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4921 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4921  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
326 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776048  normal  0.185256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  50.99 
 
 
520 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  51.01 
 
 
499 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  51.34 
 
 
493 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  51.34 
 
 
493 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  51.68 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  49.34 
 
 
506 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  49.67 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  49.01 
 
 
494 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  47.81 
 
 
505 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  47.09 
 
 
512 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  45.37 
 
 
526 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  41.43 
 
 
507 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  41.21 
 
 
499 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  41.61 
 
 
501 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  41.48 
 
 
500 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.48 
 
 
526 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  42.17 
 
 
506 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  44.16 
 
 
514 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  43.61 
 
 
499 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  39.3 
 
 
502 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 
508 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  40.91 
 
 
500 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  41.5 
 
 
500 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.12 
 
 
498 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 
500 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  41.58 
 
 
497 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.03 
 
 
498 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.03 
 
 
498 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.03 
 
 
498 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.86 
 
 
497 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
499 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.89 
 
 
498 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.93 
 
 
497 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  41.4 
 
 
499 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  39.55 
 
 
511 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  41.72 
 
 
501 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  37.46 
 
 
517 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  39.23 
 
 
511 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  43.71 
 
 
491 aa  205  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40 
 
 
498 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40 
 
 
498 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  38.54 
 
 
500 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  38.87 
 
 
500 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  41.74 
 
 
512 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.88 
 
 
500 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  38.87 
 
 
500 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  37.04 
 
 
508 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
506 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  39.66 
 
 
494 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
493 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  39.03 
 
 
501 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
493 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
493 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
493 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
493 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
501 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  39.53 
 
 
500 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  39.24 
 
 
535 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.32 
 
 
495 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  40.66 
 
 
509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  40.38 
 
 
503 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 
505 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  35.81 
 
 
520 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  40.13 
 
 
504 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  37.38 
 
 
503 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
520 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  39.16 
 
 
503 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  39.03 
 
 
501 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  39.16 
 
 
503 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 
504 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 
504 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  37.79 
 
 
516 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  39.03 
 
 
504 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 
504 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
520 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  41.42 
 
 
510 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 
504 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 
504 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  39.18 
 
 
527 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 
504 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 
520 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  38.12 
 
 
512 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 
510 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  38.44 
 
 
512 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>