More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3616 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 526 aa  1043    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  64.23 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  61.34 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  45.94 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  48.37 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  46.25 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  49.28 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  47.31 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  45.25 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  47.31 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  44.2 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  45.55 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  42.65 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  45.33 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  41.38 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  42.74 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  41.34 
 
 		 507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  42.25 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  41.14 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  41.94 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  41.85 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  42.28 
 
 		 535 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  41.72 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  42.08 
 
 		 504 aa  321  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  39.27 
 
 		 500 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  38.87 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  39.47 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  39.88 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 526 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  39.68 
 
 		 500 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  41.33 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  41.37 
 
 		 509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  40.52 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  41.57 
 
 		 503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  41.33 
 
 		 504 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  41.13 
 
 		 504 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  41.13 
 
 		 504 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  39.16 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  44.98 
 
 		 500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  40 
 
 		 526 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 		 512 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.78 
 
 		 526 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.78 
 
 		 526 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.78 
 
 		 526 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.78 
 
 		 513 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  37.95 
 
 		 513 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  37.94 
 
 		 508 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  38.99 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  39.47 
 
 		 520 aa  300  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  38.46 
 
 		 510 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  38.87 
 
 		 500 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  39.55 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  42.17 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  39.76 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  39.1 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  39.1 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  36.92 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  39.62 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  38.88 
 
 		 519 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  39.75 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  44.63 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  37.31 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  36.76 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  38.95 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.2 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.2 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.36 
 
 		 499 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  35.7 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  36.11 
 
 		 501 aa  286  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  40.96 
 
 		 505 aa  286  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  38.43 
 
 		 509 aa  286  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  35.46 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  37.98 
 
 		 511 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  37.98 
 
 		 511 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  39.77 
 
 		 508 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  35.37 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  38.05 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  38.05 
 
 		 511 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  41.48 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  38.72 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  35.66 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  38.16 
 
 		 498 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.73 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>