More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2018 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  93.55 
 
 		 527 aa  966    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  66.99 
 
 		 535 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  99.61 
 
 		 512 aa  1045    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  86.11 
 
 		 510 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 504 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  68.75 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  68.75 
 
 		 503 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  67.38 
 
 		 504 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  68.36 
 
 		 509 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  85.94 
 
 		 510 aa  901    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 504 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  67.97 
 
 		 504 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 504 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 512 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 504 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 504 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  67.58 
 
 		 504 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  60.84 
 
 		 520 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  53.28 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  53.29 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  51.98 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  50.89 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  48.42 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  46.08 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  49.41 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.18 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  42.13 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.07 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  40.81 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  44.42 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.27 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  40.31 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  41.93 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 		 508 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  41.14 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  41.08 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  40.44 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  41.98 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  41.98 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  39.02 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  39.57 
 
 		 526 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  39.38 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  45.22 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  39.38 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  39.38 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  44.74 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  39.38 
 
 		 513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  44.34 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  44.79 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  42.38 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  43.35 
 
 		 477 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  42.61 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  38.18 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  41.5 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  39.18 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.76 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.57 
 
 		 513 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.57 
 
 		 513 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  38.81 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  38.61 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  39.05 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  44.5 
 
 		 508 aa  328  9e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  38.82 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  38.57 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 519 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 519 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  41.68 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  41.68 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  38.11 
 
 		 519 aa  325  9e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  38.54 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  38.99 
 
 		 505 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  40.24 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  41.12 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  42.28 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  42.28 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  40.77 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  39.38 
 
 		 512 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  38.24 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  39.33 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 		 520 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  37.35 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  37.94 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  38.04 
 
 		 501 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  39.92 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  42.29 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  35.32 
 
 		 502 aa  299  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  41.78 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>