30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4353 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  51.43 
 
 		 218 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  48.02 
 
 		 218 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0390  hypothetical protein  30.22 
 
 		 148 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  26.91 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  25.58 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  25.58 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  31 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1781  hypothetical protein  34.34 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  30.1 
 
 		 169 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  25.71 
 
 		 169 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  23.91 
 
 		 178 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  26.95 
 
 		 169 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  27.88 
 
 		 169 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  28.29 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  28.29 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  25.55 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6728  hypothetical protein  28.7 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00401956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  27.14 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  27.19 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  28.43 
 
 		 169 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7195  hypothetical protein  21.28 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  26.97 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>