28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3155 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  69.23 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  69.23 
 
 		 169 aa  250  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  69.23 
 
 		 169 aa  250  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  68.05 
 
 		 169 aa  248  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  68.64 
 
 		 169 aa  247  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  64.5 
 
 		 169 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  64.5 
 
 		 169 aa  238  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  63.91 
 
 		 169 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  64.5 
 
 		 169 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  63.91 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  62.72 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  63.31 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  63.91 
 
 		 169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  63.31 
 
 		 169 aa  233  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  60.36 
 
 		 169 aa  230  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  37 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  34.81 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  34.07 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  33.33 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  29.81 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  32.69 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  30.1 
 
 		 339 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0390  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1781  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>