27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3728 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  349  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  78.11 
 
 
169 aa  279  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  73.96 
 
 
169 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  73.96 
 
 
169 aa  260  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  73.37 
 
 
169 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  73.37 
 
 
169 aa  258  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  73.37 
 
 
169 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  72.78 
 
 
169 aa  256  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  69.82 
 
 
169 aa  251  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  246  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  246  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  68.05 
 
 
169 aa  246  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  68.64 
 
 
169 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  64.5 
 
 
169 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  32.59 
 
 
263 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  31.85 
 
 
263 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  27.91 
 
 
218 aa  61.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  29.41 
 
 
339 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  29.41 
 
 
218 aa  51.2  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  30.48 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  27.88 
 
 
206 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0390  hypothetical protein  23.81 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>