27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4988 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  38.02 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  41.12 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  37.23 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  35.45 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  35.45 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  35.45 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  28.21 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  28.21 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  29.06 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  32.43 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  34.55 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  32.73 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  30.36 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  24.53 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  24.77 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  27.19 
 
 		 339 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4088  hypothetical protein  28.81 
 
 		 253 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00307127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>