27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3463 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  87.08 
 
 
178 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  38.02 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  28.72 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  33.04 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  32.14 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  34 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  29.81 
 
 
169 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  25.55 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  29.81 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  31.07 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  22.29 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  25.58 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  29.13 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  29.13 
 
 
169 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  29.13 
 
 
169 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  28.16 
 
 
169 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  28.16 
 
 
169 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  28.16 
 
 
169 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  29.13 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  27.18 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  29.81 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  28.16 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4088  hypothetical protein  29.36 
 
 
253 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00307127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  27.88 
 
 
169 aa  48.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  27.18 
 
 
169 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>