26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0551 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  94.67 
 
 		 169 aa  331  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  94.67 
 
 		 169 aa  331  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  92.9 
 
 		 169 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  84.02 
 
 		 169 aa  305  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  83.43 
 
 		 169 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  82.25 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  81.66 
 
 		 169 aa  297  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  82.25 
 
 		 169 aa  297  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  72.19 
 
 		 169 aa  259  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  71.01 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  72.78 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  72.19 
 
 		 169 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  71.01 
 
 		 169 aa  253  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  69.23 
 
 		 169 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  68.64 
 
 		 169 aa  247  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  37.98 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  37.78 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  37.78 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  37.04 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  35.45 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  26.16 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  30.1 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  28.43 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  26.16 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>