26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3479 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  344  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  344  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  96.45 
 
 
169 aa  333  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  94.67 
 
 
169 aa  331  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  85.8 
 
 
169 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  85.21 
 
 
169 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  84.62 
 
 
169 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  84.02 
 
 
169 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  84.02 
 
 
169 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  71.6 
 
 
169 aa  258  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  72.19 
 
 
169 aa  255  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  72.78 
 
 
169 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  72.19 
 
 
169 aa  253  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  69.82 
 
 
169 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  250  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  246  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  38.76 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  36.3 
 
 
263 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  36.3 
 
 
263 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  35.56 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  35.45 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  25.58 
 
 
218 aa  54.3  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  29.13 
 
 
206 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  30.1 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  28.29 
 
 
339 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  25.58 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>