29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3680 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  438  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  79.45 
 
 
218 aa  341  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  51.43 
 
 
339 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  27.78 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  26.84 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  29.1 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1781  hypothetical protein  33.82 
 
 
569 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  28.12 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  25.55 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  27.33 
 
 
169 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  27.33 
 
 
169 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  27.33 
 
 
169 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  29.07 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0390  hypothetical protein  29.8 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  28.47 
 
 
169 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  25.58 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  25.58 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  26.16 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4088  hypothetical protein  33.01 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00307127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  24.43 
 
 
169 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  28.43 
 
 
169 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  24.77 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>