14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0390 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  298  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  30.22 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  29.8 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7195  hypothetical protein  26.35 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  31.82 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  29.52 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1304  hypothetical protein  23.39 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  23.81 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  22.86 
 
 		 169 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00590505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  22.86 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  22.86 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  22.86 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  25.17 
 
 		 169 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>