26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0550 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  343  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  96.45 
 
 
169 aa  333  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  96.45 
 
 
169 aa  333  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  92.9 
 
 
169 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  85.21 
 
 
169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  84.02 
 
 
169 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  83.43 
 
 
169 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  82.84 
 
 
169 aa  297  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  82.84 
 
 
169 aa  297  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  72.19 
 
 
169 aa  259  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  73.96 
 
 
169 aa  256  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  72.19 
 
 
169 aa  254  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  70.41 
 
 
169 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  68.05 
 
 
169 aa  248  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  68.64 
 
 
169 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  44.79 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  34.81 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  34.81 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  34.07 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  37.14 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  27.91 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  31.07 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  26.79 
 
 
218 aa  47.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  26.97 
 
 
339 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>