26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1288 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1288  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  339  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.951152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4988  hypothetical protein  33.86 
 
 
189 aa  90.9  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.835848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0551  hypothetical protein  38.4 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3479  hypothetical protein  35.58 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0551  hypothetical protein  35.58 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0550  hypothetical protein  34.97 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163657  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0661  hypothetical protein  33.14 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3322  hypothetical protein  32.16 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3529  hypothetical protein  33.13 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.798608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  30.15 
 
 
263 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  34.38 
 
 
263 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3155  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0432  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0603  hypothetical protein  33.59 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4350  hypothetical protein  32.81 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
263 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  30.39 
 
 
339 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3940  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281073  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3758  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.454067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0510  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000578885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3814  hypothetical protein  37 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3463  hypothetical protein  34 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3728  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3651  hypothetical protein  27.01 
 
 
218 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3680  hypothetical protein  28.16 
 
 
218 aa  61.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00910852  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3842  hypothetical protein  34 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.493078  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>