16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6728 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6728  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00401956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2835  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1334  hypothetical protein  28.22 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2478  hypothetical protein  28.36 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545885  normal  0.0244888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4079  hypothetical protein  30.99 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741455  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6195  hypothetical protein  30.13 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1555  hypothetical protein  26.72 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4567  hypothetical protein  30.82 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1322  hypothetical protein  30.82 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3868  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4353  hypothetical protein  28.7 
 
 		 339 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0256336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2490  hypothetical protein  27.4 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1377  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.600318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3753  hypothetical protein  30.66 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1365  hypothetical protein  26.87 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1462  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>